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文件权限问题导致plink报错 Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.
晚上兴起,想起一直以来没有解决的问题,于是复制一个目录,开始跑数据,但是跑到第一步就采坑
plink --chr-set 95 --file merge --mind 0.1 --geno 0.1 --maf 0.05 --chr 1-18 --recode --out 21JAN
报错,(没有复制全)
Failed to open 21JAN.log. Try changing the --out parameter.
找了半天原因,网上也没找到,后来想起可能是权限问题,于是
sudo chmod -R 777 testyy
居然跑通了
把权限改到755 ,错误又变了
PLINK v1.90b6.22 64-bit (16 Apr 2021) www.cog-genomics.org/plink/1.9/
(C) 2005-2021 Shaun Purcell, Christopher Chang GNU General Public License v3
Logging to 21JAN.log.
Options in effect:
--chr 1-18
--chr-set 95
--file merge
--geno 0.1
--maf 0.05
--mind 0.1
--out 21JAN
--recode
31470 MB RAM detected; reserving 15735 MB for main workspace.
出处:https://www.cnblogs.com/jilingxf/p/15837897.html
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